Bioloogiliste interaktsioonide all on mõeldud liikide, organismide ja rakkude vahelisi suhteid. Bioloogiliste interaktsioonide uurimine on elussüsteemide teoorias kujunenud keskse huvi valdkonnaks.

Bioloogiliste interaktsioonide hulka kuuluvad näiteks sümbioos, konkurents, parasitism, kisklus, amensalism, kommensalism. Bioloogiliste suhete liikideks on muuhulgas suhted patogeenidega, tolmeldajatega, mükoriisaga, aga ka liigikaaslastega ning - rakulisel tasemel - suhted kudede vahel, rakkudevahelised interaktsioonid.

Teoreetiliselt huvitavate probleemide hulka kuuluvad kindlasti interaktsioonide moodustumine, interaktsioonide spetsiifilisus, interaktsioonide tüpoloogia, eritüübiliste interaktsioonide stabiilsus ja roll organismis ja koosluses, interaktsioonide plastilisus ja determinatsioon, interaktsioonide suktsessioonilised ja evolutsioonilised tendentsid.